河南和新疆地区HIV-1毒株gp120和gag基因的变异分析

• 作者: 何翔 孙峰 宋艳辉 张远志 王哲 邢辉 邵一鸣 陈建平
• 来源期刊: 中国艾滋病性病
• 学科: 医学
• 关键词: 艾滋病病毒Ⅰ型 基因距离 选择压力 系统进化树
• 年，卷（期）: 2007,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 405-408
• 页数: 4页
• 分类号: R373.9
• 字数: 2491字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5662.2007.05.001

摘要

目的 分析中国河南和新疆地区艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)毒株gp120和gag基因全长序列的变异特征.方法 PCR扩增河南和新疆HIV-1确认阳性样本前病毒DNA gp120和gag全长基因,测序得到40份gp120和41份gag基因序列,用GCG软件包等软件进行分析.结果 河南省HIV-1毒株为B′亚型,新疆维吾尔自治区HIV-1毒株为CRF07_BC亚型.B′亚型毒株gp120基因中变异程度最大的区段是V5区段,最小的是C1区段;CRF07_BC亚型毒株中变异最大的是V1区段,最小的是C4区段.两种亚型毒株gp120和gag基因的Ks/Ka值＜1(P＜0.05).结论 对于病毒基因全长序列的分析可以更多地反映病毒的特性.gp120基因各个区段在B′和CRF07_BC亚型毒株中的变异程度不一致.B′和CRF07_BC亚型毒株的gp120基因和gag基因都受到正向选择压力的作用.