大肠杆菌O85 O-抗原基因簇序列破译和特异分子标识的筛选

• 作者: 冯露 刘斌 刘雪倩 孙丹 王威 王磊
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 大肠杆菌O85 O-抗原基因簇 分子分型 分子标识
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 39-44
• 页数: 6页
• 分类号: R3
• 字数: 5345字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2007.01.010

摘要

目的 测定大测肝菌O85的O-抗原基因簇的序列,对其基因进行功能和进化的分析,筛选并鉴定可用于快速分子分型的特异分子标识.方法 利用鸟枪法对大肠杆菌O85的O-抗原基因簇进行测序,生物信息学方法进行序列拼接与分析,确定针对大肠杆菌O85的特异基因并设计引物,PCR方法进行模拟环境样品的检测.结果 大肠杆菌O85的O-抗原基因簇序列全长为11 203 bp.发现8个开放阅读框架(orf)并确定功能,分别为:UDP-N-乙酰葡萄糖-2-异构酶基因(of f1),吡喃型UDP-半乳糖变位酶基因(glf),糖基转移酶基因(orf3、orf5、orf6和orf8),O-抗原转运酶基因(wzx)和O-抗原聚合酶基因(wzy).鉴定出针对大肠杆菌O85的特异基因2个和引物4对.结论 本文筛选的特异分子标识和PCR检测方法可用于对环境样品中的大肠杆菌O85进行快速、灵敏的检测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙丹	南开大学生命科学学院	16	144	7.0	11.0
2	冯露	南开大学泰达生物技术学院	12	48	3.0	6.0
3	王威	南开大学泰达生物技术学院	13	21	2.0	4.0
4	王磊	南开大学泰达生物技术学院	66	520	11.0	21.0
5	刘斌	南开大学生命科学学院	42	430	13.0	19.0
6	刘雪倩	南开大学泰达生物技术学院	1	0	0.0	0.0