不同地区幽门螺杆菌cagA基因羧基端可变区及其蛋白序列差异分析

• 作者: 吴莺 张尤历 沈琰 王文兵 陈劲频
• 来源期刊: 世界华人消化杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 幽门螺杆菌 细胞毒性相关基因A EPIYA基序 差异
• 年，卷（期）: 2007,（7）
• 所属期刊栏目: 临床经验
• 页码范围: 746-749
• 页数: 4页
• 分类号: R3
• 字数: 3882字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-3079.2007.07.016

摘要

目的:比较不同地区H pylori cagA 3'端可变区序列差异及序列的地域特征,分析差异与疾病的相关性.方法:选择本实验室所收集的20例CagA+的PCR产物进行测序,并通过ExPASy-Translation软件推测其氨基酸序列,搜索并收集GenBank中已公布的不同地区3-6个H pyloricagA 3'端可变区序列及其氨基酸序列进行比较分析.结果:cagA蛋白的氨基酸序列可分为具有明显地域特征的东亚型和西方型两类;部分东亚型菌株表现出西方型变异.87.4%的菌株具有3个串联排列的EPIYA基序,8.2%的菌株具有4个或以LEPIYA基序.新发现1条具有区域特征的含有3个氨基酸的序列.cagA蛋白氨基酸序列中的EPIYA数目与临床结果没有相关性.结论:Hpylori cagA基因及其cagA蛋白序列具有明显多态性,可以根据Hpylori cagA 3'端可变区的主要序列差异进行地域分型,cagA 3'端可变区的EPIYA基序的数目与临床结果没有相关性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张尤历	江苏大学附属医院消化科	122	578	12.0	17.0
2	陈劲频	江苏大学附属医院消化科	11	60	5.0	7.0
3	王文兵	江苏大学生命科学院	108	565	12.0	19.0
4	吴莺	江苏大学附属医院消化科	55	250	8.0	13.0
5	沈琰	江苏大学附属医院消化科	13	63	5.0	7.0