广东地区人禽流感H5N1血凝素基因特征与进化

• 作者: 李晖 柯昌文 邹丽容 陈秋霞 黄平
• 来源期刊: 中国公共卫生
• 学科: 医学
• 关键词: 人禽流感 H5N1 毒株 血凝素(HA)基因 进化
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 专题报道之一——禽流感免疫研究
• 页码范围: 390-392
• 页数: 3页
• 分类号: R392
• 字数: 3021字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1001-0580.2007.04.003

摘要

目的 通过对广东地区人禽流感H5N1毒株(HA)基因序列的变异分析,揭示毒株HA基因变异与进化.方法 对广东地区人禽流感H5N1毒株(A/GD/01/06)HA基因测序,同时检索全球各地人禽流感H5N1毒株HA基因,采用SPSS 11.0和DNAStar5.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株HA基因核苷酸序列进行聚类、比对和分析;并结合临床资料对变异毒株进行进化速度分析.结果 1997～2006年,42毒株HA基因序列聚类分成3类;HA基因89氨基酸位点置换,占15.7%(89/568);2003～2006年H5N1,毒株通过氨基酸第170～172位(NST/S)位点的置换,增加一个糖基化位点.同义变异中,HA基因Ks为1.99×10-5～2.58×10-5,生物进化线性回归方程为Y=4.8×10-9X+1.048×10-5;同时各毒株Ks均大于Ka,进化检验Ks/Ka值显示HA基因进化压力主要来自自然变异.42株H5N1毒株可以分3条进化途径,1997～1998年毒株为1条,2003～2005年东南亚毒株为第2条途径,2005～2006年中国毒株为第3条途径.毒株HK-213-03氨基酸变异显示其变异的进化过度性,而2004年毒株TL-L2004-04氨基酸位点变异值得注意.结论 2003～2006年人禽流感H5N1毒株HA基因抗原性与1997年毒株有较大不同,人禽流感H5N1,毒株增加一个糖蛋白位点可能改变毒株致病性;少数毒株氨基酸位点变异较大,值得关注.人禽流感H5N1毒株在自然界变异频繁,但受到鸟禽和人体的免疫压力较小;但随着H5N1,毒株自然进化,H5N1,毒株具有人-人传播能力的概率较大.建议在研制人禽流感H5N1毒株疫苗时,要充分考虑不同毒株HA基因抗原性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	柯昌文		154	1211	18.0	26.0
2	黄平		60	448	11.0	16.0
3	陈秋霞		34	100	6.0	9.0
4	李晖		62	599	15.0	21.0
5	邹丽容		26	130	8.0	10.0