基于AdaBoost方法的蛋白质磷酸化修饰规则抽取

• 作者: 蔡津津 贺思敏 赵杰煜
• 来源期刊: 计算机工程与设计
• 学科: 医学
• 关键词: 磷酸化 规则抽取 预测 氨基酸性质 AdaBoost算法
• 年，卷（期）: 2007,（11）
• 所属期刊栏目: 人工智能
• 页码范围: 2623-2628
• 页数: 6页
• 分类号: TP399|R857.3
• 字数: 7808字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7024.2007.11.039

摘要

磷酸化是最重要的蛋白质翻译后修饰之一,随着蛋白质磷酸化数据的增加,利用已有数据对蛋白质磷酸化修饰进行规律挖掘和预测的条件日益成熟.设计新的基于AdaBoost(adaptive boost)分类器的规则抽取算法和利用修饰位点附近氨基酸性质作为特征并采用AdaBoost方法进行特征选择和分类器训练的磷酸化修饰位点预测方法AproPhos(using amino acid properties for phosphorylation sites prediction),使其在具有较高预测精度的同时可以对预测结果进行可理解的规则解释,规则抽取还有助于发现新的磷酸化修饰氨基酸性质分布规律,对揭示生命活动规律和药物开发有着重要意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵杰煜	宁波大学计算机科学技术研究所	82	637	14.0	21.0
2	贺思敏	中国科学院计算技术研究所	9	90	4.0	9.0
3	蔡津津	中国科学院计算技术研究所	2	5	2.0	2.0