中国H5N1禽流感病毒HA基因的分子进化分析

• 作者: 刘杨安 卢扬柏 张玲 朱利 赖沛龙 赵卫
• 来源期刊: 微生物学免疫学进展
• 学科: 医学
• 关键词: H5N1 血凝素基因(HA) 分子进化分析
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 所属期刊栏目: 病毒
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: R373.9
• 字数: 1967字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-5673.2008.03.001

摘要

为了阐明中国H5N1禽流感病毒血凝素(HA)基因的分子进化规律,从GenBank下载中国近年来分离的27株禽流感H5N1病毒的HA基因,利用LaserGene软件包中的EditSeq程序剪切共同序列并翻译成氨基酸序列,与DNAMAN软件进行比对,并以LaserGene软件包中的MegAlign程序构建分子进化树,结合背景资料分析其传播流行规律.结果显示: ①在HA裂解位点上游毗邻的位置,gdch04、gddu04、gxch0405、gxdu05、gxqu0502、hkcph05、stch05、stqu05、ynch0502株都缺失了三个碱基;②27株毒株在HA裂解位点上游毗邻的位置存在多个连续的碱性氨基酸;③来自广西的gxch0405、gxdu05、gxqu0502和来自香港的hkcph05、hkgh04的序列同源性很高,很可能与苍鹭的迁移有关;④来自广西的gxqu0502和来自香港的hkcph05亲源关系很近,很可能来自同一祖先.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵卫	南方医科大学公共卫生与热带医学学院病毒研究所	66	254	8.0	13.0
2	朱利	南方医科大学公共卫生与热带医学学院病毒研究所	24	87	5.0	8.0
3	张玲	南方医科大学公共卫生与热带医学学院病毒研究所	29	183	8.0	12.0
4	刘杨安	南方医科大学公共卫生与热带医学学院病毒研究所	1	0	0.0	0.0
5	赖沛龙	南方医科大学公共卫生与热带医学学院病毒研究所	1	0	0.0	0.0
6	卢扬柏	南方医科大学公共卫生与热带医学学院病毒研究所	1	0	0.0	0.0