恙虫病东方体0t56蛋白序列生物信息学分析

• 作者: 刘昌政 周晓红 李华 李小聪 郭瑜琪
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 恙虫病东方体 Ot56蛋白 生物信息学
• 年，卷（期）: 2008,（8）
• 所属期刊栏目: 基础研究论著
• 页码范围: 775-778,787
• 页数: 5页
• 分类号: R513.2
• 字数: 3173字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-3619.2008.08.007

摘要

目的 分析恙虫病东方体Ot56蛋白序列中的变异区和保守区,为恙虫病的蛋白与核酸诊断提供参考.方法 从GenBank获取口标序列,用Lasergene、MEGA、Vector NTI suite、AthePort和NCBI Blast等工具进行分析.结果 120条Ot56氨基酸序列的相似性为61.4%～100.0%.变异度为0.0～57.1;氨基酸的105～171、179～215、248～285、375～428和447～503区域为高变异区;膜外区200～400具有变异度高、抗原性强的特性.113条Ot56 cDNA序列的相似性为41.8%～100.0%,变异度为0.0～116.1;其中303v481、562～667、756～842、1136～1243和1386～1568等5个区域属高变异区.而0～54、97～171、265～303、439～482、1015～1047和1477～1542为6个保守片段.结论 恙虫病东方体Ot56蛋白具有5个高变异区,第200～400位氨基酸附近可能是株(型)特异性表位所在区域,其重组蛋白具有潜在的株(型)鉴定价值.根据cDNA 6个保守片段设计引物,进行Ot56核酸检测可能在不同株(型)恙虫病东方体检测中具有较高的敏感性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李华	南方医科大学公共卫生与热带医学学院病原生物系	65	491	13.0	18.0
2	周晓红	南方医科大学公共卫生与热带医学学院病原生物系	29	190	9.0	11.0
3	郭瑜琪	南方医科大学公共卫生与热带医学学院病原生物系	3	12	2.0	3.0
4	刘昌政	南方医科大学公共卫生与热带医学学院病原生物系	5	12	2.0	3.0
5	李小聪	南方医科大学公共卫生与热带医学学院病原生物系	1	3	1.0	1.0