汉坦病毒浙江分离株ZT71株的全基因核苷酸序列测定及分析

• 作者: 姚苹苹 徐芳 朱智勇 朱海坪 翁景清 谢荣辉
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 汉坦病毒 序列分析 汉城型
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 149-153
• 页数: 5页
• 分类号: R3
• 字数: 3395字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0254-5101.2008.02.015

摘要

目的 为了获得浙江省汉坦病毒基因组更为详尽的资料,研究汉坦病毒的进化状况及变异程度,为疫苗病毒株的选择使用提供科学依据.方法 设计特异性引物,RT-PCR分段扩增ZT71株全长L、M和S片段,PCR产物纯化后克隆于T载体并进行序列测定.然后进行遗传进化分析.结果 汉坦病毒ZT71株L、M及S基因分别由6530、3651和1753个核苷酸组成,分别编码2151、1133和429个氨基酸.基因比较分析表明,ZT71株与SEO型汉坦病毒比较其L片段核苷酸同源性为95.5%～99.7%,氨基酸同源性为99.0%～99.3%;M片段核苷酸同源性为84.1%～99.6%,氨基酸同源性为95.3%～99.2%;S片段核苷酸同源性为88.7%～99.5%,氨基酸同源性为96.5%～99.1%;而与其他汉坦病毒同源性则较低.结论 测定了ZT71株的全基因核苷酸序列,其L、M和S片段具有和其他汉坦病毒L、M、S片段相似的核苷酸一级结构,但与SEO型更为接近,属于SEO型病毒.