福建省肠道病毒71型分离株(2010FJLY008)全基因组核苷酸序列分析

• 作者: 严延生 吴冰珊 周朝晖 张拥军 沈晓娜 王金章 翁育伟 谢剑锋 郑奎城 陈炜
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 肠道病毒71型 全基因组 核苷酸序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 14-18
• 分类号: R373.2
• 字数: 3623字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2011.01.004

摘要

目的 了解肠道病毒71型在福建省的遗传背景,追踪EV71流行过程中可能发生的变异.方法 对2010年福建1例手足口病患儿标本中分离到的1株肠道病毒71型分离株(2010FJLY008)进行全基因组核苷酸序列测定,并对基因组序列进行同源性比较及遗传进化分析.结果 2010FJLY008株全长7 403bp,核苷酸及编码氨基酸序列同源性比较,均与08年阜阳流行株Fuyang17.08-2同源性最高,整个基因组核苷酸同源性为98.2%,氨基酸同源性为99.5%;全长基因组核苷酸序列遗传进化分析及VP1区基因遗传进化分析,与Fuyang17.08-2株进化关系较为接近,同属于C4a基因亚型.结论 2010年福建省EV71型病毒流行株(2010FJLY008)在病毒基因组结构、基因组核苷酸同源性比较、编码氨基酸同源性比较、全长基因组核苷酸序列遗传进化分析及VP1区基因遗传进化分析等方面,均与2008年阜阳流行株(Fuyang17.08-2)关系密切,未产生明显的抗原漂移及变异.