肠道病毒EV71型浙江分离株HZ08全基因组序列分析

• 作者: 姚苹苹 徐芳 朱函坪 朱智勇 杨章女 谢荣辉 黄潇潇
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 肠道病毒71型 全基因组 序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（8）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 679-682
• 分类号: R373
• 字数: 2526字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2011.08.001

摘要

目的:了解浙江省流行的肠道病毒71型HZ08株的基因特征,研究肠道病毒71型的进化及变异状况.方法:设计特异性引物,RT-PCR扩增HZ08株全基因,PCR产物纯化后克隆干T载体并进行序列测定和基因进化分析.结果::HZ08株的全基因组由7 405个核苷酸组成,编码2 193个氨基酸.HZ08的5非编码区(UTR)、VP1、VP2、VP3、VP4、P2、P3、3非编码区(UTR)和全基因组的核苷酸与C4亚型的毒株序列较高,分别为96.2％～99.1％,92.6％～99.1％,92.7％～98.4％,88％～99.2％,93.8％～99.5％,89.4％～99.2％,91.4％～98.8％,87.8％～100％和91.1％～98.9％.HZ08株与其他亚型各区段的核酸同源性均低于90％.根据VP1基因和全基因序列进行种系统发生分析显示HZ08株与中国陆和台湾的病毒进化关系较近,与国际标准株以及东南亚毒株进化关系统较远.其中HZ08株与国内流行株BJ08和Fuyang08的进化关系最近.HZ08株与C4亚型相关氨基酸序列一致,VP1的抗原性表位发生了变异.结论:HZ08病毒分离株为C4亚型,与Fuyang08和BJ08株进化途径相同,为肠道病毒71型的基因组功能学和疫苗学研究奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姚苹苹		58	222	9.0	11.0
2	徐芳		30	126	7.0	9.0
3	朱函坪		41	133	6.0	8.0
4	谢荣辉		26	130	7.0	10.0
5	朱智勇		51	171	7.0	9.0
6	杨章女		13	37	4.0	5.0
7	黄潇潇		3	10	2.0	3.0