两株不同毒力EV71全基因组序列测定及分析

• 作者: 孟红 宋楠楠 岳盈盈 张颖 李志会 李鹏 盖中涛
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: EV71 毒力 全基因组 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 413-417
• 分类号: R373.2
• 字数: 2991字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2012.05.001

摘要

目的 了解济南市2008年EV71的流行和变异情况,寻求潜在的EV71毒力决定位点.方法 采用分段扩增的RT-PCR方法 对EV71 JN200803和JN200804株的基因组全长进行扩增、测序.对两株EV71的全基因组核苷酸、氨基酸序列进行比较,对非编码区进行RNA二级结构的预测和分析,并对VP1区和全基因组进行遗传进化分析.结果 EV71 JN200803和JN200804株的基因组全长分别为7 405 nt和7 404 nt,编码区没有核苷酸的插入和缺失,全基因组序列的组成和结构均符合肠道病毒71型的特征.JN200803和JN200804全基因组有106个核苷酸突变,编码区98个,非编码区8个,编码区多数属于同义突变,仅造成16个氨基酸突变.遗传进化分析显示,EV71 JN200803和JN200804株与2008年国内其他流行株同属C4亚型的C4a进化分支,与Fuyang/17.08/1株进化关系最近.结论 2008年济南市流行的EV71属于C4a亚型,济南分离株的毒力决定位点不但具有非单一性,而且具有较为独特的济南区域特点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	盖中涛		22	109	5.0	10.0
2	李鹏	山东省医学科学院基础医学研究所山东省罕少见病重点实验室	28	96	6.0	8.0
3	岳盈盈	山东省医学科学院基础医学研究所山东省罕少见病重点实验室	31	69	5.0	6.0
4	李志会	山东省医学科学院基础医学研究所山东省罕少见病重点实验室	24	64	5.0	6.0
5	宋楠楠	山东省医学科学院基础医学研究所山东省罕少见病重点实验室	21	46	5.0	6.0
6	张颖		11	93	4.0	9.0