基于两类全基因组距离的EV71型病毒亲缘关系分析

• 作者: 向妍 周玮 张永生 徐西林
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: EV71病毒 全基因组 E距离 Kimura 2-parameter距离 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2014,（30）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 10469-10471,10502
• 页数: 4页
• 分类号: S188
• 字数: 2173字
• 语种: 中文

摘要

[目的]了解世界各地EV71病毒的亲缘关系.[方法]下栽了NCBI数据库所有EV71全基因组序列,以常用的Kimura 2-parameter距离和E距离进行距离矩阵邻接法建树.[结果]基于E距离和Kimura 2-parameter距离构建的进化树结果一致,2种方法均支持EV71进化树反映出的基于全基因组的病毒亲缘关系.[结论]E距离是病毒系统发育应用中另一种颇具潜力的新距离,能为鉴定EV71病毒亲缘关系提供支持.