肠道病毒71型中国西安分离株全基因组核苷酸序列分析

• 作者: 卢晓玲 李一为 李亚蓉 杜全丽 杨扬 郑海潮 马超锋 黄银娟
• 来源期刊: 现代检验医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肠道病毒71型 序列分析 同源性分析 系统进化
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 16-18
• 分类号: R373.2|Q754
• 字数: 1608字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7414.2010.04.007

摘要

目的 分析肠道病毒71型西安分离株(XA87-2008)全基因组核苷酸序列特征.方法 参考相关毒株序列,设计7对可重叠扩增全基因组的引物.提取一株2008年分离自西安市儿童医院手足口病病例标本的病毒基因组RNA,合成cDNA,进而扩增出7个目的片段,插入T载体克隆,对阳性克隆测序.利用MegAlign进行同源性分析,MEGA4软件进行进化分析.结果 XA87-2008毒株基因组全序7 414 bp,同源性分析与安徽阜阳2008年毒株高度同源,与其它基因亚型相差较大;进化分析显示其VP1区和全基因组序列均与C4基因亚型在同一进化支.结论 XA87-2008毒株为C4亚型,在进化关系上与近年来中国大陆流行株关系密切.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马超锋		38	209	9.0	12.0
2	杜全丽		14	73	3.0	8.0
3	黄银娟		6	8	2.0	2.0
4	李一为		7	69	3.0	7.0
5	郑海潮		13	59	5.0	7.0
6	杨扬		6	12	1.0	3.0
7	李亚蓉		1	1	1.0	1.0