福建省一株猪瘟病毒流行毒株全基因组序列测定与分析

• 作者: 刘建奎 戴爱玲 曾建平 杨小燕 林炜明 魏春华
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪瘟病毒 全基因组 序列分析 遗传变异
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 36-41
• 页数: 6页
• 分类号: S852.651
• 字数: 3129字
• 语种: 中文

摘要

根据GenBank公布的猪瘟病毒(CSFV)标准参考毒株全基因组序列,设计11对引物,应用RT-PCR方法分别对11个片段进行福建流行毒株CN-FJLY的全基因组扩增,与参考毒株进行序列分析比较.结果表明,福建流行毒株CN-FJLY基因组全长为12296 bp,与参考毒株SXCDK、HEBZ、GXWZ02、HN-LY-2011和Zj0801的全基因组核苷酸同源性为93.0％～97.0％,而与1.1亚群的中国强毒Shimen、疫苗株HCLV全基因组核苷酸同源性为84.4％～85.3％.基于全基因组及E2基因构建的遗传进化树分析结果表明福建流行毒株CN-FJLY属于2.1b亚群,与Shimen株、HCLV疫苗株亲缘关系较远.与HCLV相比较CN-FJLY基因组变异较大的是5′UTR、Ems、E2、p7、NS2、NS5A、NS5B和3′UTR.综上说明福建省猪瘟病毒流行毒株正在向远离疫苗株的方向变异.