广西一株流行猪瘟毒株全基因序列的克隆和序列分析

• 作者: 单虎 吴发兴 张志 张燕霞 朱小甫 李晓成 郑加宾
• 来源期刊: 中国动物检疫
• 学科: 农学
• 关键词: 猪瘟 基因组序列 同源性分析 GX54株
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 23-25
• 页数: 3页
• 分类号: S8
• 字数: 2593字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-944X.2008.03.014

摘要

本实验参照已发表的猪瘟病毒(CSFV)石门株、HCLV株、Paderborn株、GXWZ02株等的基因组序列设计合成了11对引物,通过RT-PCR方法从广西一株流行猪瘟病料中直接扩增得到了11个片段,将所得片段克隆至PGEM-Teasy载体上,经过测序、拼接,最终得到广西猪瘟GX54基因组全序列.序列分析表明,GX54基因组全长12296个碱基.与国内外已发表的10株猪瘟病毒系列进行同源性分析,结果表明,与各株核苷酸同源性分别为85.1%、85.0%、85.1%、84.7%、84.8%、94.4%、84.3%、94.3%、84.8%、84.5%.系统发育树分析发现,所比较的11个毒株可以分为2群,1群包括GX54,GXWZ02和Paderborn株,其余毒株属于2群,其中GX54株与GXWZ02株关系最近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张燕霞		27	305	10.0	16.0
2	吴发兴		52	436	12.0	19.0
3	张志		47	459	12.0	19.0
4	李晓成		65	578	14.0	21.0
5	单虎		183	631	12.0	17.0
6	郑加宾		1	1	1.0	1.0