烟草EST数据库构建及cDNA阵列技术建立

• 作者: 卢秀萍 宋利民 戴承恩 方永启 李德葆 李文正 李永平 董海涛 骆红梅
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 烟草 表达序列标签 cDNA阵列 实时定量PCR
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 662-669
• 页数: 8页
• 分类号: S188
• 字数: 6952字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2008.04.020

摘要

一组容量为5 927条烟草(Nicofiana tabacum)EST的数据(GenBank登录号为CV015900～CV021826),包含521个重叠群和3 079个独立EST.EST数据分析显示:高丰度表达基因主要涉及光合代谢、蛋白合成等植物基本的生理功能;而低丰度表达基因则占假定独立转录本(TUTs)总数的85.5%.在此基础上,制备完成cDNA阵列,并应用于盐胁迫下烟叶的基因表达谱分析,结果表明,盐胁迫即可使烟草叶片的基因表达谱发生显著改变,并涉及多个重要的植物生理过程.包括水通道蛋白PIP2a、乙烯应答蛋白酶和mRNA剪接因子prp31等42个基因的检出,为阐明植物胁迫反应的调控机制提供新的线索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李德葆	浙江大学生物技术研究所	76	2052	28.0	43.0
2	董海涛	浙江大学生物技术研究所	30	637	12.0	25.0
3	李永平		96	941	16.0	27.0
4	卢秀萍		117	1429	22.0	32.0
5	李文正		28	261	9.0	15.0
6	宋利民		2	11	2.0	2.0
7	方永启	浙江大学生物技术研究所	3	16	3.0	3.0
8	骆红梅	杭州师范大学生命与环境科学学院	5	33	4.0	5.0
9	戴承恩	浙江大学生物技术研究所	2	9	2.0	2.0