利用DNA池和测序技术快速筛查候选效应单倍型

• 作者: 崔建勋 张细权 杜红丽
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: DNA池 测序 单倍型
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 281-285
• 页数: 5页
• 分类号: S188
• 字数: 3471字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2008.02.018

摘要

选取产蛋性能具有明显差异的4个鸡(Gallus gallus)品种(莱航鸡、阳山鸡、丝羽乌骨鸡和隐性白洛克鸡)构建品种DNA池,通过测序研究鸡催乳素基因5'-侧翼调控区部分序列(1 028 bp)的单倍型,快速筛查到由4个单核苷酸多态性(SNP)位点(C-2402T、C-2161G、C-2062G和G-2040A)组成的2种最常见单倍型CCCG和TGGA,其中CCCG在莱航鸡品种中的频率接近1,可能利于产蛋.再利用RFLP和SSCP将这4个位点在品种及家系中进行基因分型,基因分型之后的统计结果与测序的结果基本相符.利用农大褐X泰和丝羽乌骨鸡家系检测CCCG单倍型的效应,发现含有此单倍型的单倍型组合具有更高的产蛋量.由6个位点组成的单倍型H3(CCTCTG,由CCCG再加上T-2101和T-2054组成)在莱航鸡的频率为1,在参考家系中检测H3的效应,发现含有H3的单倍型组合具有很高的产蛋量,并且与其它类型达到显著性差异.从研究可见,利用这种方法能有效地筛查到可能的效应单倍型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔建勋	广东省农业科学院科技情报研究所	35	228	8.0	13.0
2	张细权	华南农业大学动物科学学院	109	1363	19.0	31.0
3	杜红丽	华南理工大学生物科学与工程学院	34	132	6.0	10.0