利用分散量理论辨识外膜蛋白

• 作者: 王正志 邹凌云 黄教民
• 来源期刊: 生命科学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 外膜蛋白 分散量 分散增量 挖掘
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 303-308
• 页数: 6页
• 分类号: Q516
• 字数: 5724字
• 语种: 中文

摘要

利用分散量的数学理论,提出了基于最小分散增量的蛋白质序列辨识方法,通过多种特征联合对蛋白质序列进行编码,并建立基于最小分散增量的分类器MID-OMP,应用于革兰氏阴性细菌外膜蛋白序列辩识,在数据集上的Jackknife测试中,MID_OMP辨识外膜蛋白和α螺旋跨膜蛋白的准确率达到95.7%,辨识外膜蛋白和球状蛋白的准确率达到91.0%;在14个细菌基因组内挖掘结果显示,MID_OMP具有较高的敏感性和特异性,预测结果的可信度明显优于另外一种OMPs挖掘工具TMBETA-GENOME.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王正志	国防科技大学机电工程与自动化学院	85	629	13.0	20.0
2	邹凌云	国防科技大学机电工程与自动化学院	6	21	2.0	4.0
3	黄教民	国防科技大学机电工程与自动化学院	7	56	4.0	7.0