H9N2亚型禽流感病毒A/Chicken/Gansu/2/99株基因组的分子特征

• 作者: 付生芳 侯顺利 常惠芸 才学鹏 易华山 独军政
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 禽流感病毒 H9N2亚型 A/Chicken/Gansu/2/99 序列分析
• 年，卷（期）: 2008,（6）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 543-547
• 页数: 5页
• 分类号: Q786|Q93
• 字数: 4605字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2008.06.014

摘要

目的 测定H9N2亚型禽流感病毒A/Chicken/Gansu/2/99(CK/GS/2/99)分离株的基因组序列并与参考毒株进行同源性分析,阐明该毒株的遗传变异及分子特征.方法 采集发病鸡泄殖腔样品,经鸡胚尿囊腔接种分离病毒,采用RTPCR方法对CK/GS/2/99株的8个分节段基因进行扩增,分别将其克隆到pGEM-T easy载体后进行序列测定与同源性分析.结果 CK/GS/2/99株PB2、PB1、PA、HA、NP、NA、M、NS基因的开放阅读框分别由2280、2274、2151、1683、1497、1401、759、864个碱基组成,分别编码759、757、716、560、498、466、252/97、231/122个氨基酸残基.该毒株HA上HA1和HA2裂解位点序列为PARSSR ↓ GLF,具有典型的低致病性禽流感病毒的特征.同源性分析显示,CK/GS/2/99株与1998-2002年间大部分中国大陆分离株遗传关系较近,尤其与CK/NX/4/99和CK/HB/31/00株遗传关系密切.结论 CK/GS/2/99·与大部分流行于中国内陆的H9N2亚型毒株均来源于共同的祖先毒株CK/BJ/1/94,这为了解中国H9N2亚型禽流感病毒的分子流行病学提供了资料.