猪瘟病毒基因表达谱芯片的可靠性研究

• 作者: 梁新华 袁建琴 高斌战
• 来源期刊: 激光生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪瘟病毒 基因芯片 表达谱 可靠性 研究
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 613-619
• 页数: 7页
• 分类号: S852.65+1
• 字数: 4986字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7146.2008.05.008

摘要

通过同种组织RNA自身比较实验及不同组织RNA的差异分析实验对猪瘟病毒(classic swine fever virus, CSFV)cDNA芯片实验的重复性进行检验.利用相关系数(correlationcoefficient, R)、变异系数(coefficientofvariation, CV)和假阳性率(falsepositiverate, FPR)分析猪瘟病毒cDNA芯片数据的可靠程度,对cDNA芯片实验数据作了整体的评估.结果证实,该芯片系统得到的猪瘟病毒cDNA表达谱数据相关系数一般大于0.9,假阳性率控制在2 %以内.另外,通过比较猪瘟病毒芯片制备中点样浓度、mRNA和总RNA以及不同标记过程对实验的影响,来分析猪瘟病毒芯片数据的系统误差来源,得出结果:重复两次实验,可以克服绝大部分实验系统引入的假阳性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	袁建琴	山西农业大学生命科学学院	42	76	5.0	5.0
2	梁新华		2	4	1.0	2.0