刚竹属3种重要散生竹光系统Ⅰ基因(Lhca 1)的克隆、序列分析和蛋白结构预测

• 作者: 唐文莉 彭镇华 高健
• 来源期刊: 北京林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 毛竹 红壳竹 角竹 Lhcal 克隆 序列分析 结构预测
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 页码范围: 109-115
• 页数: 7页
• 分类号: S718.3|S759
• 字数: 5248字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-1522.2008.04.019

摘要

光系统I(Psl)在植物光合系统中具有重要功能,Lhcal是编码PSI复合物中最主要的捕光色素蛋白LHCI的基因.该研究采用RT-PcR法,从毛竹中克隆了捕光叶绿素a/b结合蛋白基因LhcaPeol(GenBank EU035496)的全长.从红壳竹和角竹中克隆了长度分别为616、613 bp的捕光叶绿素db结合蛋白基因片段HwaH01(GenBankEU513200)、LhcaJ01(GenBank EU513201).运用生物信息学方法对其核苷酸序列、编码的氨基酸序列以及蛋白结构进行预测.结果表明,LhcaPeol基因序列从第39 bp开始到第779 bp含有1个开放阅读框和一个中止密码子,该基因全长1 051 bp,在5'端有38 bp的非编码区,在3'端含有242 bp的非编码区和Poly(A)30 bp.对这3个基因的保守片段的序列分析表明,刚竹属3种竹种毛竹、红壳竹和角竹保守区内核酸序列同源性非常高,在禾本科内不同属之间毛竹与大麦序列同源性最高,玉米次之.编码的氨基酸序列同源性与核酸序列同源性一致,最高是毛竹与大麦,水稻次之.经推测LhcaPepl编码的蛋白质等电点和分子量分别为5.400 0和22 107.34 D.蛋白质结构预测表明,毛竹、大麦、水稻、玉米的LHCI蛋白结构非常相似.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭镇华	国际竹藤网络中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室	215	5170	37.0	60.0
3	高健	国际竹藤网络中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室	56	732	16.0	24.0
6	唐文莉	国际竹藤网络中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室	2	32	2.0	2.0