10种海参16SrDNA序列多样性及其亲缘关系分析

• 作者: 李赟 费来华 陈家鑫
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 海参 16SrDNA 系统发生
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 755-765
• 页数: 11页
• 分类号: S917|Q959.269
• 字数: 6101字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2008.05.006

摘要

运用PCR扩增10种海参的16SrDNA部分序列,并测序.获得大小为566bp的序列,利用DNAsp4.0软件分析比较10种海参的碱基组成、各碱基变异位点数、插入或缺失位点数,并采用MEGA4.0软件分析彼此间的遗传距离.结果发现,10种海参富含AT碱基,A+T的含量平均为57.0%,不同种海参间发生碱基转换、颠换及发生插入或缺失变异的位点数差异很大,10种海参彼此间的遗传距离在0.007～0.316之间.所得结果与GenBank中10种海参的相应序列进行比对分析,同时用MEGA4.0和PAUP4.0软件构建进化树,分析其亲缘关系.结果表明,利用16SrDNA序列的差异可以将分属于海参科(Holothuriidae)与刺参科(Stichopodidae)的海参完全分开,瓜参科(Cucumariidae)的2个种与刺参科的亲缘关系较近.对不同海参种间亲缘关系的分析结果还表明,同属于剌参科的仿刺参(Apostichopus japonicus)与加州拟刺参(Parastichopus californicus)和具疣拟刺参(Parastichopus parvimensis)亲缘关系最近,同属于海参科的格皮氏海参(Pearsonothuria graeffei)与白尼参属的蛇目白尼参(Bohadschia argus)和图纹白尼参(B.marmorata)亲缘关系最近,而同样为海参科的墨西哥海参(Holothuria mexicana)则与红腹海参(Hothuria edulis)关系最近.这些资料为海参的种质资源管理、新种引进和种质改良提供了基础的分子生物学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李赟		48	532	14.0	20.0
2	费来华		3	46	3.0	3.0
3	陈家鑫	中国水产科学研究院黄海水产研究所	3	34	2.0	3.0