水稻基因结构分析与预测建模

• 作者: 周艳红 朱建丽 程遥 马闯
• 来源期刊: 华中科技大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 基因结构预测 水稻基因组 C+G含量 多级优化
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 计算机与控制科学
• 页码范围: 62-64
• 页数: 3页
• 分类号: TP181|Q78
• 字数: 2579字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1671-4512.2008.04.017

摘要

将水稻基因结构预测问题划分为基因级、元件级和特征级等多个层次上的一系列较简单子问题,分析了各特征与序列C+G含量之间的依赖关系,通过采用从简单到复杂逐级优化的策略建立了不同序列C+G含量的水稻基因结构模型,设计了基因结构寻优的动态规划算法,开发了水稻基因结构预测软件Rice-GenePRE.采用测试数据集OsSNG550对该软件进行测试的结果显示:RiceGenePRE在核苷酸、外显子和基因水平上的预测效果均优于水稻基因结构预测系统FGENESH.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周艳红	华中科技大学生物信息与分子成像湖北省重点实验室	26	243	9.0	15.0
2	朱建丽	华中科技大学生物信息与分子成像湖北省重点实验室	4	2	1.0	1.0
3	马闯	华中科技大学生物信息与分子成像湖北省重点实验室	2	2	1.0	1.0
4	程遥	华中科技大学生物信息与分子成像湖北省重点实验室	1	1	1.0	1.0