肠出血性大肠杆菌O157:H7的紧密黏附素基因eae的测序及生物信息学分析

• 作者: 万成松 仲华 吴仲鑫 周勇 彭丽娟 贡树基
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 大肠杆菌O157:H7 eae基因 克隆 序列测定 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2008,（2）
• 所属期刊栏目: 基础研究论著
• 页码范围: 93-96
• 页数: 4页
• 分类号: R378.21
• 字数: 2982字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-3619.2008.02.001

摘要

目的 克隆编码肠出血型大肠杆菌O157:H7的紧密黏附素eae基因,并对其进行测序及生物信息学分析,为研究EHEC与宿主细胞相互作用奠定基础.方法 利用PCR技术扩增eae基因,经过纯化,将其定向插入克隆载体PMD19-T simple vector并进行测序,应用生物信息学软件分析其生物学特性.结果 用PCR方法扩增eae基因,大小为2802 bp,编码934个氨基酸,用DNAstar5.0软件分析紧密黏附素(Intimin)蛋白的生物活性,在202～210、510～520、716～735个氨基酸残基的肽链上,显示该蛋白具有良好的亲水性,在175～220、300～315、550～610、710～780、825～880个氨基酸残基的肽链上具有良好的柔韧性,在220～300、615～710个氨基酸残基的肽链上,显示该蛋白具有良好的抗原性.结论 本研究用PCR法扩增出了O157:H7的eae基因,成功构建了肠出血性大肠杆菌O157:H7紧密黏附素eae基因的重组质粒,并分析了黏附素蛋白的亲水性、柔韧性、抗原性,为进一步研究大肠杆菌O157:H7黏附素的致病机制奠定了基础,为下一步表达出Intimin蛋白,进一步研究该蛋白与宿主细胞的粘附、免疫原性、抗原抗体反应提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	万成松	南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学系	54	328	12.0	16.0
2	吴仲鑫	南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学系	2	10	2.0	2.0
3	周勇	南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学系	8	83	4.0	8.0
4	贡树基		2	8	1.0	2.0
5	彭丽娟	南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学系	4	16	2.0	4.0
6	仲华	南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学系	4	37	3.0	4.0