涪陵水牛mtDNA D-loop 区遗传多样性研究

• 作者: 卢群志 吴平 姚福吉 李明晖 苏锐 谢文美 陈宏 雷初朝
• 来源期刊: 西北农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 涪陵水牛 mtDNAD-loop 遗传多样性 单倍型 支系
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 页码范围: 56-60
• 页数: 5页
• 分类号: S823.8+3.2
• 字数: 4021字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-1389.2008.05.013

摘要

利用测序技术和生物信息学分析技术, 对涪陵水牛27个个体的线粒体DNA D-loop 915 bp全序列的遗传多样性及系统进化进行分析,检测到16种单倍型,其核苷酸多态位点48个,约占所测核苷酸总长的5.24%,其中有43个转换,5个颠换.涪陵水牛mtDNA D-loop区核苷酸多样度(π值) 为0.0196±0.0020, 单倍型多样度(H)为0.9060±0.0460,表明涪陵水牛mtDNA 遗传多样性丰富.根据单倍型构建了涪陵水牛的NJ分子系统树,发现存在沼泽型水牛支系A和B,表明涪陵水牛具有2个母系起源.