米氏凯伦藻18S rDNA和转录间隔区序列分析

• 作者: 张凤英 郑俊斌 陆亚男 马凌波
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 米氏凯伦藻 核糖体18SrDNA 转录间隔区 系统进化 分子鉴定
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 页码范围: 680-685
• 分类号: S917
• 字数: 3083字
• 语种: 中文

摘要

对赤潮多发藻米氏凯伦藻(Karenia mikimotoi)核糖体18S rDNA及其转录间隔(ITS) 区序列PCR扩增并测序,获得18S rDNA和ITS基因序列长度分别为1 690 bp和654 bp.结合12种甲藻和1种硅藻作序列比较分析,分别在ITS1、ITS2序列寻找到适宜设计特异性引物探针区域,并用邻接法构建系统进化树,研究各藻种间亲缘关系.遗传距离分析结果显示米氏凯伦藻与短凯伦藻(Karena brevis)、微小卡罗藻(Karlodinium micrum )等分类学上较近的藻种18S rDNA序列相似度为97%～99%,远大于微小原甲藻(Prorocentrum minimum)、海洋原甲藻(P.micans)、塔玛亚历山大藻(Alexandrium tamarense)等在分类学上相距较远的藻种,各藻种间的ITS序列平均相似度明显低于18S rDNA序列.以18S rDNA与ITS序列构建的进化树拓扑结构相一致,18S rDNA序列相对保守,适合进行属以上关系的系统进化分析,而ITS序列变异较大,适合种属间鉴别分析,且ITS1和ITS2是变异很大的区域,适合种间的分子特异性鉴定,这为快速鉴别赤潮多发藻米氏凯伦藻提供了依据,进而为治理赤潮提供帮助.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张凤英	中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室	25	488	13.0	22.0
2	郑俊斌	中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室	2	26	2.0	2.0
6	马凌波	中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室	28	483	12.0	21.0
7	陆亚男	中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室	25	127	6.0	10.0