基于寡核苷酸芯片的β-地中海贫血DNA甲基化的研究

• 作者: 梁志清 聂艳丽 胡华 高天
• 来源期刊: 第三军医大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: β-地中海贫血 DNA甲基化 v-erb-a 寡核苷酸芯片 MSP
• 年，卷（期）: 2009,（24）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 2469-2472
• 页数: 4页
• 分类号: R394-33|R556.61|R714.55
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-5404.2009.24.017

摘要

目的 通过寡核苷酸芯片寻找和分析β-地中海贫血DNA甲基化相关的基因位点,进一步探讨产前筛查及诊断β-地中海贫血的新方法.方法 利用含有人30 178个DNA甲基化探针的寡核苷酸芯片,对2例β地中海贫血患儿脐血与2例正常脐血分别配对检测差异基因DNA甲基化情况,并用甲基化特异PCR(methylation-specific PCR,MSP)和荧光定量PCR(RT-PCR)验证芯片结果.采用非监督聚类(hierarchical clustering)等方法发现统计学意义上差异表达的基因.结果 两组芯片结果显示,差异基因共209条(ratio≥2.0,ratio≤0.5);其中上调基因共113条,下调基因共96条.验证结果显示,DNA甲基化相关基因成红细胞增多型白血病致病因子(erythroblastie leukemia viral,v-erb-a)与正常血样比较呈高甲基化状态.结论 利用DNA甲基化芯片及甲基化特异PCR技术检测并验证出成红细胞增多型白血病致病因子(v-erb-a)在地中海贫血中呈高甲基化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁志清	第三军医大学西南医院妇产科	272	2095	21.0	30.0
2	胡华	第三军医大学西南医院妇产科	27	89	6.0	9.0
3	高天	第三军医大学西南医院妇产科	5	12	2.0	3.0
4	聂艳丽		3	1	1.0	1.0