沙棘耐盐基因HrNHX1的克隆及3'UTR序列分析

• 作者: 于静 沙依拉 罗淑萍 郭长奎
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 沙棘 3'RACE 3'UTR HrNHX1基因 耐盐
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 页码范围: 1031-1035
• 页数: 5页
• 分类号: S188
• 字数: 2806字
• 语种: 中文

摘要

以沙棘(Hippophae rhamnoides L.)叶片为材料,用改良SDS法提取总RNA,反转录合成第一链cDNA作为模板,根据已公布NHX1家族同源序列保守区设计简并引物,扩增出沙棘中HrNHX1基因的中间序列,然后用快速扩增cDNA末端(rapid amplification on of cDNA end,RACE)方法,从沙棘中克隆到HrNHX13'cDNA序列.该序列(GenBank登录号:EU718492)长度为1 373 bp,与已知NHXI序列同源性最大为80%,其编码区1 094 bp,编码364个氨基酸,3'非翻译区(3'-untranslated resion,3'trm)长度为239 bp.3'UTR序列分析显示沙棘的3'UTR与陆地棉、葡萄柚和小盐芥的同源性分别为43.97%、45.63%和40.64%,明显低于编码区的同源性.结果表明,NHX1基因编码区具有较高的保守性,3'UTR序列的同源性较低,显示了非编码区在环境适应中的重要性,并为进一步研究沙棘对生境的适应分子机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗淑萍		152	1655	22.0	30.0
2	郭长奎		14	102	8.0	10.0
3	于静		9	66	5.0	8.0
4	沙依拉		1	4	1.0	1.0