双龙方组分诱导大鼠BMSCs分化的差异基因筛选及聚类分析

• 作者: 李雪 梁琼麟 王义明 罗国安 胡坪 范雪梅
• 来源期刊: 高等学校化学学报
• 学科: 化学
• 关键词: 双龙方 基因芯片 差异表达基因 聚类分析
• 年，卷（期）: 2009,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1729-1732
• 页数: 4页
• 分类号: O657
• 字数: 3002字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0251-0790.2009.09.009

摘要

利用基因芯片筛选双龙方有效组分(总人参皂苷及总丹酚酸)诱导大鼠骨髓间充质干细胞(BMSCs)类心肌细胞分化过程中的差异表达基因, 并对其进行聚类分析, 在基因水平研究了双龙方组分对大鼠BMSCs分化的影响. 对大鼠BMSCs进行分组培养, 分别收集10, 20, 30及40 d的细胞样本, 提取tRNA, 经基因芯片检测, 筛选出BMSCs变化过程中的差异表达基因并进行生物信息学分析, 同时通过差异表达基因对样本进行Hierarchical聚类分析. 在BMSCs的分化过程中, 筛选出179条差异表达基因, 经分析发现它们与能量代谢和信号传导等多类基因密切相关. 对样本进行聚类分析发现其聚为两大类: 10和20 d的样本聚为一类, 30和40 d的样本聚为一类. 说明BMSCs在20～30 d之间可能发生了显著的改变.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王义明	清华大学化学系	283	6640	40.0	69.0
2	梁琼麟	清华大学化学系	102	1494	20.0	31.0
3	胡坪	华东理工大学化学与分子工程学院	57	868	16.0	28.0
4	李雪	清华大学医学院	35	246	9.0	13.0
5	范雪梅	华东理工大学药学院	4	37	3.0	4.0