臭矢菜丛枝病植原体的分子鉴定研究

• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 臭矢菜丛枝病 植原体 分子鉴定 序列测定
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 病原学
• 页码范围: 377-384
• 页数: 8页
• 分类号: S432.4
• 字数: 4044字
• 语种: 中文

摘要

本实验采用DAPI荧光显微镜、PCR、克隆和测序等技术,对海南臭矢菜丛枝病样进行了检测和鉴定.以染病臭矢菜总DNA为模板应用3对植原体特异性引物进行PCR扩增,获得PCR产物为16S rDNA(1 430 bp)、16S-23S rDNA(358bp)、rp DNA(1 294 bp).应用DNA回收试剂盒获得了3个PCR扩增片断的纯化产物,并克隆到DH5α大肠杆菌中测序.应用DNAMAN和MEGA软件对获得的序列与NCBI数据库中植原体序列进行同源性分析和构建系统发育树.结果显示臭矢菜丛枝病植原体与花生丛枝病植原体序列同源性最高,16S rDNA的序列同源性为99.9%,16S-23S rDNA高达100%,rp为99.7%,因而将臭矢菜丛枝病植原体归为花生丛枝组(16Sr Ⅱ),根据16S rDNA的RFLP分析,将其归为16Sr Ⅱ-A亚组.