条斑紫菜半胱氨酸合成酶基因的电子克隆与分析

• 作者: 刘楚吾 周向红 易乐飞 王萍
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 条斑紫菜 半胱氨酸合成酶 电子克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 518-524
• 页数: 7页
• 分类号: Q94
• 字数: 4833字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2009.04.006

摘要

从网络共享的条斑紫菜(PorphyrayezoensisUeda)表达序列标签(expressed sequencetag,EST)数据库检索出与拟南芥(Arabidopsis thaliana)半胱氨酸合成酶(cysteine synthase,CSase)基因高度相似的EST序列,构建EST叠连群(contig),并依据contig设计引物.提取条斑紫菜叶状体总RNA,采用RT-PCR方法,扩增得到了条斑紫菜半胱氨酸合成酶基因(PyCSase-B)的cDNA序列(GenBank accession:FJ232911).该cDNA序列含有长1 152 nt的完整开放阅读框,编码产物(PyCSase-B)的分子量39.3 kD,长383 AA.PyCSase-B的N端前60个氨基酸残基构成了叶绿体转运肽序列,成熟的PyCSase-B定位在叶绿体中.PyCSase-B与紫红紫菜(P.purpurea)、莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)、拟南芥和水稻(Oryza sativa)的序列一致性分别为94%、69%、64%和65%,进化树显示PyCSase-B在进化上处在细菌和高等植物之间.PyCSase-B含有与5'-磷酸吡哆醛(Pyridoxal 5'-phosphate)和O-乙酰丝氨酸(O-acetylserine)结合的保守氨基酸残基和序列,含有将硫转移到半胱氨酸的保守残基;成熟PyCSase-B单体的三维结构与拟南芥CSase相似,由2个α/β结构域组成.PyCSase-B的成功克隆与生物信息学分析有助于进一步研究其在条斑紫菜抗逆调控中的作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘楚吾	广东海洋大学水产学院	105	1315	18.0	30.0
2	王萍	淮海工学院江苏省海洋生物技术重点实验室	98	909	15.0	24.0
3	易乐飞	淮海工学院江苏省海洋生物技术重点实验室	33	189	9.0	11.0
4	周向红	淮海工学院江苏省海洋生物技术重点实验室	29	209	9.0	12.0