小麦叶片蛋白质组的2D-LC分离及Nano LC-MS/MS分析

• 作者: 刘静 徐世昌 徐琴 潘映红 罗继 赵奎军
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 蛋白质组学 小麦叶片 二维液相色谱 纳升级液相色谱串联质谱
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 772-780
• 页数: 9页
• 分类号: S5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.03.003

摘要

[目的]二维液相色谱(2D-LC)与双向电泳(2-DE)技术具有互补性,本文旨在探讨利用2D-LC和纳升级液相色谱串联质谱(Nano LC-MS/MS)技术分离鉴定小麦叶片蛋白质组的新方法.[方法]小麦叶片蛋白经提取、脱盐后,进行第一维阴离子交换分离;收集洗脱组分进行SDS-PAGE分析,并对非高丰度蛋白组分进行第二维反相液相色谱分离;随机选择含较低吸收峰的部分组分经胰蛋白酶水解后进行Nano LC-MS/MS分析;将串联质谱数据通过MASCOT搜索NCBInr和EST数据库,并对二级质谱获得的蛋白序列进行MS BLAST分析.[结果]经第一维阴离子交换色谱分离,收集得到15个组分,其中第15组分包含小麦叶片丰度最高的蛋白--1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(RuBisCO);其余14个组分经反相液相色谱分离,共收集1551个组分,获得1867个色谱峰;随机对其中6个含较低吸收峰的收集组分酶解和Nano LC-MS/MS检测,9种蛋白得到鉴定.[结论]结果初步表明,利用2D-LC和Nano LC-MS/MS技术可有效地分高和鉴定小麦叶片蛋白质组,为更深入全面地研究小麦叶片蛋白质组奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵奎军	东北农业大学农学院	134	1308	19.0	28.0
2	潘映红	东北农业大学农学院	1	12	1.0	1.0
3	徐琴	东北农业大学农学院	1	12	1.0	1.0
4	罗继	东北农业大学农学院	1	12	1.0	1.0