肺炎克雷伯临床菌株新基因组岛KpGI-2的鉴定

• 作者: 吕元 李敏 欧竑宇 蒋晓飞 陈晓耘 陈楠 魏取好
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 关键词: 肺炎克雷伯菌 基因组岛 细胞生长 fic
• 年，卷（期）: 2009,（10）
• 所属期刊栏目: 细菌学
• 页码范围: 869-873
• 页数: 5页
• 字数: 4766字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2009.10.001

摘要

目的 研究肺炎克雷伯临床耐药菌株新基因组岛KpGI-2的结构和功能.方法 采用PCR方法自一株肺炎克雷伯耐药菌株HS04160扩增得到新的插入序列KpGI-2,通过测序以及生物信息学方法分析其序列结构并推测其生物学功能,采用细菌生长试验证实其生物学功能.结果 phe55 tRNA基因位点处PCR扩增得到的6.4 kb的插入序列KpGI-2,序列分析发现其GC含量为38.03%,明显低于肺炎克雷伯菌株基因组平均的GC含量(57.5%).KpGI-2中含有163 bp的重复序列,可以确定为一个新的基因组岛.KpGI-2携带有5个orf,其中orf5与沙门菌属中的Fic(fllamentation induced by cAMP)蛋白具有高度相似性.肺炎克雷伯临床菌株普遍携带有一个高度保守的fic基因以及一个相对保守的fic基因,携带有KpGI-2的临床菌株HS04160丢失了相对保守的fic基因.通过细菌生长试验分析发现orf5以及KpGI-2在cAMP诱导下对细胞生长具有调节作用,KPGI-2的功能可能与细菌生长的调节相关.结论 KpGI-2是位于肺炎克雷伯临床菌株基因组岛插入热点phe55 tRNA基因位点上的一个新基因组岛,其携带的基因与细胞生长相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蒋晓飞	复旦大学附属华山医院检验医学科	65	553	13.0	21.0
2	吕元	复旦大学附属华山医院检验医学科	65	447	12.0	18.0
3	李敏	复旦大学附属华山医院检验医学科	93	463	11.0	17.0
4	陈楠	复旦大学附属华山医院检验医学科	7	12	2.0	3.0
5	魏取好	复旦大学附属华山医院检验医学科	7	66	3.0	7.0
6	欧竑宇	上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢实验室	6	16	3.0	4.0
7	陈晓耘	复旦大学附属华山医院检验医学科	3	25	2.0	3.0