猪源副黏病毒JL-1株全基因获得及遗传变异分析

• 作者: 丁壮 丛彦龙 刘美 吴昊 孟轲音 尹仁福 李少丽 李志杰 毕玉海 王昌庆 邱蜜蜜
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪源副黏病毒 新城疫病毒 全基因组
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 预防兽医学
• 页码范围: 125-128
• 页数: 4页
• 分类号: S852.659.5
• 字数: 2689字
• 语种: 中文

摘要

利用本实验室分离保存的猪源副黏病毒JL-1株来提取病毒基因组RNA.参考GenBank发表的相关禽副粘病毒Ⅰ型(Avian paramyxovirus serotype 1,APMV-1)基因组序列,设计了8对特异性引物,RT-PCR法分别特异性的扩增出病毒各基因片段,并将各目的基因片段回收纯化,将纯化后的PCR产物进行测序.测定结果得到NP、P、M、F、HN、La、Lb、Lc 8段基因序列,利用DNAMAN软件进行拼接得到基因组全长cDNA序列(GenBank登录号:EU546165).序列分析结果表明,PPMV JL-1株与各地代表株核苷酸同源性87.85%～99.78%,与鹅源新城疫(GPMV)ZJ-1、NA-1株核苷酸同源性分别为83.31%、83.46%,同时根据各毒株F基因开放阅读框前389个核苷酸序列绘制出系统发育进化树,结果表明PPMV JL-1株与LaSota同属于基因Ⅱ型,不同于基因Ⅶ型的ZJ-1和NA-1株的鹅源毒株.