猪源冠状病毒TGEV中国分离株纤突蛋白生物信息学分析

• 作者: 兰喜 吴润 娄忠子 李学瑞 李宝玉 李建强 杨彬 柳纪省 殷相平 程杰
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 猪源冠状病毒 猪传染性胃肠炎 纤突蛋白 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 95-98
• 页数: 4页
• 分类号: Q5
• 字数: 2473字
• 语种: 中文

摘要

以猪源冠状病毒(Porcine coronavirus) TGEV 纤突蛋白基因序列为基础,利用生物软件对TGEV中国分离株纤突蛋白进行N-糖基化位点、跨膜螺旋、进化树、二级结构及抗原位点的预测和分析.结果显示所有TGEV毒株可分为3个基因型,4株中国分离株分别归属于以上3个基因型,属于Ⅰ型的中国株TSX在跨膜螺旋的氨基酸及二级结构上与其他中国株有明显的差异,而同属于Ⅲ型中国毒株SC-Y和TH- 98在跨膜螺旋的氨基酸及二级结构上非常接近,而所有中国分离株抗原表位没有明显差别,表明TGEV在中国没有显著的变异.