福氏2a志贺菌DNA转录激活蛋白MarA的二级结构及其B细胞抗原表位预测

• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（科技版）
• 学科: 农学
• 关键词: 福氏2a志贺菌 DNA结合转录激活蛋白MarA 二级结构 B细胞表位
• 年，卷（期）: 2009,（11）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 1-3
• 页数: 3页
• 分类号: S852.6
• 字数: 2349字
• 语种: 中文

摘要

研究以福氏2a志贺菌(Shigella flexneri 2a,s.f 2a)的基因组序列为材料,采用Gamier-Robson法、Chou-Fasman法和Kamplus-Schulz法预测了其DNA结合转录激活蛋白MarA的二级结构,用Kyte-Doolittle法对结构蛋白的亲水性进行了分析,用Emini法预测了蛋白的表面可能性,以Jameson-Wolf法预测了蛋白的抗原指数,然后综合评价了福氏2a志贺菌转录激活蛋白MarA的B细胞抗原表位.结果表明:福氏2a志贺菌MarA蛋白的二级结构较为复杂,含有较多的转角和无规则卷曲等柔性区域以及α-螺旋和β-折叠区段,该蛋白有多处抗原指数较高的区段,其中含有潜在的B细胞优势抗原表位,因此其在免疫学中的地位也应当引起重视.