多杀性巴氏杆菌基因组分泌蛋白的预测分析

• 作者: 余旭平 谭双 黄贤波
• 来源期刊: 湖北农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 多杀性巴氏杆菌 分泌蛋白 信号肽 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（11）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 2642-2645
• 页数: 4页
• 分类号: S852.61~+2|O78
• 字数: 3250字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0439-8114.2009.11.007

摘要

分泌蛋白对于细菌自身的生命活动以及在介导病原体与宿主之间相互作用的过程中发挥着重要的作用,深入研究分泌蛋白将有助于明确细菌的生命活动及与病原微生物互作的分子机制.利用多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida)基因组学研究成果,结合信号肽分析软件SignalP v3.0、跨膜螺旋结构软件TMHMM v2.0、亚细胞器蛋白定位软件PSORTb和GPI-锚定位点软件GPI-SOM这4个软件,对多杀性巴氏杆菌2105个编码蛋白的ORF进行预测分析,最终获得了136个分泌蛋白.对其信号肽长度、氨基酸组成、相应ORF长度进行了统计.运用Blast P对其功能进行同源性分析,发现11个蛋白为多杀性巴氏杆菌所特有,这对多杀性巴氏杆菌的临床诊断具有一定的潜在应用价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	余旭平	浙江大学动物科学学院	67	501	12.0	18.0
2	谭双	浙江大学动物科学学院	3	18	2.0	3.0