细胞核rDNA序列分析5种罗非鱼的亲缘关系

• 作者: 叶卫 喻达辉 符云 郭奕惠 黄桂菊
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 罗非鱼 细胞核rDNA 序列变异 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2009,（8）
• 所属期刊栏目: 农业生物技术
• 页码范围: 3444-3447
• 页数: 4页
• 分类号: S917
• 字数: 3458字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2009.08.041

摘要

[目的]探索五种罗非鱼的亲缘关系.[方法]从尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼、杂交种尼奥罗非鱼、莫桑比克罗非鱼和红罗非鱼基因组中提取DNA,通过PCR扩增其ITS1基因序列及18S、5.8S部分序列并进行序列分析.[结果]扩增片段大小约700 bp,测序结果显示获得的序列包括完整的ITS1区以及18S和5.8S部分序列.序列长度变异主要在ITS1区,18S和5.8S片段的序列长度没有发生变化.罗非鱼5个种的ITS1序列的碱基组成差别不大.从UPGMA聚类结果上看,尼罗罗非鱼与尼奥罗非鱼聚为一支;莫桑比克罗非鱼与奥利亚罗非鱼聚为一支,红罗非鱼再与莫-奥聚合.[结论]五种罗非鱼的ITS1及18S、5.8S部分序列分析结果表明,尼罗和尼奥罗非鱼亲缘关系较近,奥利亚与莫桑比克罗非鱼亲缘关系较近,红罗非鱼可能与奥利亚和莫桑比克罗非鱼有一定的亲缘关系.