细胞核rDNA序列用于罗非鱼及其杂交种鉴别的初步研究

• 作者: 喻达辉 郭奕惠
• 来源期刊: 福建水产
• 学科: 农学
• 关键词: 罗非鱼 细胞核rDNA 序列变异 种类鉴定
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 页码范围: 25-30
• 页数: 6页
• 分类号: S9
• 字数: 3300字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-5601.2009.01.006

摘要

罗非鱼种间,尤其是尼罗罗非鱼与杂种尼奥罗非鱼之间,很难区分.本文对尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼、莫桑比克罗非鱼和杂交种尼奥罗非鱼 (尼罗罗非鱼♀9×奥利亚罗非鱼δ)和红罗非鱼的核糖体DNA内部转录间隔子1(IYS1)序列及其两侧的18S和5.8S部分序列特征进行分析,以筛选种间鉴别标记.PCR扩增产物大小约700 bp,测序结果表明,(去除弓l物后) 18S长146 bp,5.8S长66 bp,不同种类之间无差异;ITS1长383-483 bp,因种类不同而异,其GC含量大于AT含量,达到67.1%.序列比对分析结果表明,18S和5.8S片段高度保守,但各有3个变异位点可以把上述几个种和杂种相互区分开;18S序列上有一个UnbI限制性酶切位点,可作为尼罗和尼奥罗非鱼的鉴别标记.ITS1序列种间变异大,系统发育分析表明,所研究的5个种聚成2个类群,尼罗与尼奥罗非鱼为一组,莫桑比克一红罗非鱼一奥利亚罗非鱼为另一组.组内种间遗传距离较小,尼罗和尼奥罗非鱼的种问遗传距离为0.006;莫桑比克、奥利亚和红罗非鱼的种间遗传距离在0.007-0.009之间;两组罗非鱼之间的遗传距离较大,在0.030-0.035之间,表明罗非鱼ITS1序列多态性较高,适合于种类区分.结合部分18S和5.8S序列,细胞核rDNA具有鉴别罗非鱼及其杂种的潜力.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	喻达辉	中国水产科学研究院南海水产研究所	55	800	18.0	26.0
2	郭奕惠	中国水产科学研究院南海水产研究所	21	262	9.0	16.0