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摘要:
[目的] 对线粒体DNA 13种蛋白质编码基因的系统进化分析能力进行了评估.[方法] 单个基因和基因拼接序列比较,综合考虑序列的信息量和邻位连接法构建系统进化树的置信度.[结果] 按分类阶元不同将基因都分成不同的4等.在鲈形目的科间阶元,最好的为ND6和cox2;好的序列为ND5和ND4;ND4L、ND3和ATP8差;包括Cyt b、cox1在内的其余6种基因为中等;在属内种间阶元,最好的为ATP6和cox2;好的序列为ND2和cox1;ND6、ND3和ATP8差;包括Cyt b在内的其余6种基因为中等.另外,分析揭示序列长度的增加可以提高系统进化树的置信度,且属内物种间比较时序列长度的影响小于高级阶元.[结论] 线粒体DNA蛋白质编码基因的信息分布具不均一性,需分类阶元选择最佳基因和组合.
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文献信息
篇名 鲈形目线粒体DNA蛋白编码基因的适用性分析
来源期刊 安徽农业科学 学科 农学
关键词 鲈形目 线粒体DNA 蛋白编码基因 系统进化
年,卷(期) 2009,(16) 所属期刊栏目 农业生物技术
研究方向 页码范围 7355-7358,7360
页数 5页 分类号 S917
字数 3671字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.0517-6611.2009.16.021
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 刘楚吾 广东海洋大学水产学院 105 1315 18.0 30.0
2 郭昱嵩 广东海洋大学水产学院 34 378 9.0 18.0
3 王中铎 广东海洋大学水产学院 29 208 6.0 13.0
4 焦阳 广东海洋大学水产学院 1 11 1.0 1.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
鲈形目
线粒体DNA
蛋白编码基因
系统进化
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
安徽农业科学
半月刊
0517-6611
34-1076/S
大16开
安徽省合肥市农科南路40号
26-20
1961
chi
出版文献量(篇)
78281
总下载数(次)
236
相关基金
国家科技支撑计划
英文译名:
官方网址:http://kjzc.jhgl.org/
项目类型:重大项目
学科类型:能源
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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