上海及新疆地区猪戊型肝炎病毒开放阅读码框架2序列的克隆与分析

• 作者: 刘佩红 刘健 周锦萍 张维谊 鞠厚斌
• 来源期刊: 中国动物传染病学报
• 学科: 农学
• 关键词: 戊型肝炎病毒 开放读码框架2 序列分析
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 26-31
• 分类号: S858.282.659.6
• 字数: 3710字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-6422.2010.04.005

摘要

通过已建立的动物戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)RT-nPCR方法,检测上海地区和新疆地区猪群样品.扩增HEV开放读码框架2(open reading frame 2,ORF2)保守区,产物为507 bp.经克隆、测序,获得20株上海株、3株新疆株序列,采用分子生物学软件与47株已知HEV进行同源性、进化关系分析.结果23株序列从同源性比对和进化关系分析均属HEV Ⅳ型,上海株间507 bp的核苷酸同源性为94.1%～100.0%,与上海猪源(DQ450072)、日本人源Japan1(AB369690)亲缘关系近;3株新疆株507 bp间的核苷酸同源性为86.1%～98.2%,与新疆猪源China SW1(AY594199)、中国人源T1株(AJ272108)亲缘关系近;上海株与新疆株间的核苷酸同源性为82.6%～100.0%,提示上海株与新疆株间存在差异.23株HEV在时间和地域关系分析,提示不同年份的新疆株存在差异,同年份不同猪场的新疆株进化关系存在差异,不同年份、不同区县的上海株进化关系也存在差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘佩红		69	286	9.0	12.0
2	张维谊		57	196	7.0	10.0
3	刘健		52	184	7.0	11.0
4	周锦萍		89	317	10.0	13.0
5	鞠厚斌		64	242	9.0	12.0