高粱生长素反应因子(ARF)基因的全基因组分析与进化研究

• 作者: 刘艳 朱苏文 江海洋 程备久 魏巍
• 来源期刊: 安徽农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 高粱 ARF基因 进化分析 保守基序
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 页码范围: 395-400
• 分类号: S514
• 语种: 中文

摘要

生长素在植物发育中的各个阶段都起着重要作用,而生长素反应因子(auxin response factors,ARF)特异性的调节生长素反应基因的表达,是植物细胞中重要的一类转录因子家族.在拟南芥、玉米、水稻等模式作物中先后克隆了一些ARF基因,但是高粱作为一种重要的经济作物,这方面的研究未见报道.随着高粱全基因组序列的公布,利用基因组序列分析ARF基因的数目、结构、进化具有重要的意义.利用公布的高粱全基因组数据,利用DNATOOLS、BLAST、MEGA4.0以及Genomepixelizer等生物信息学软件对高粱(Sorghum bicolor)生长素反应因子ARF基因的数量、物理位置、系统进化树、氨基酸序列及保守基序(motif)的保守性等进行分析. 结果表明, 在高粱全基因组中共有26个ARF基因,26个ARF基因根据其进化关系分为A、B、C 3类; 通过对全基因组内ARF基因进行物理位置和基因家族分析,发现高粱基因组中ARF基因存在明显的基因复制现象, 基因的复制对高粱基因组中ARF基因数量扩张起到了重要的作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱苏文	安徽农业大学生命科学学院	89	736	15.0	22.0
2	程备久	安徽农业大学生命科学学院	111	852	16.0	23.0
3	江海洋	安徽农业大学生命科学学院	45	259	10.0	14.0
4	刘艳	安徽农业大学生命科学学院	21	57	5.0	7.0
5	魏巍	安徽农业大学生命科学学院	4	22	1.0	4.0