亚洲棉ARF基因家族全基因组鉴定与分析

• 作者: 冯庭 司国阳 李国辉 蔡永萍 郭宁
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 农学
• 关键词: 亚洲棉 ARF 进化关系
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 22-28
• 页数: 7页
• 分类号: S759.95
• 字数: 4529字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.201702001

摘要

生长素响应因子(ARF)是植物中可以特异性结合生长素应答基因启动子的转录因子,在植物的生长发育中起着重要的调控作用.为了更好的了解亚洲棉中ARF基因家族的种类和数量,本文利用生物信息学的方法,分析了亚洲棉基因组中ARF基因的种类、进化关系、物理定位以及基因的结构和保守基序.结果表明在亚洲棉基因组中发现并初步确定了29个ARF基因,命名为GaARF,通过基因定位发现除在2、3、5、11号染色体上没有ARF基因外,其他染色体上都有ARF基因存在;而且在10号染色体上还存在着基因簇;进化树分析表明,亚洲棉部分ARF蛋白和已知功能的拟南芥聚类到一起;表达模式分析显示,不同组织不同处理条件下ARF基因的表达存在差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡永萍	安徽农业大学生命科学学院	167	2775	29.0	45.0
2	郭宁	安徽农业大学生命科学学院	31	104	5.0	8.0
3	李国辉	安徽农业大学生命科学学院	3	3	1.0	1.0
4	司国阳	安徽农业大学生命科学学院	2	4	1.0	2.0
5	冯庭	安徽农业大学生命科学学院	1	1	1.0	1.0