鲤TRAP分子标记反应体系的建立与优化

• 作者: 明俊超 曲疆奇 梁政远 苏胜彦 董在杰 袁新华
• 来源期刊: 动物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 鲤 TRAP标记 体系 优化
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 72-78
• 分类号: Q953
• 语种: 中文

摘要

针对鲤(Cyprinus carpio)这一主要水产养殖品种设计了靶位区域扩增多态性(target region amplified polymorphism,TRAP)分子标记的反应体系,对影响TRAP反应体系的各参数,包括Mg2+、dNTPs、Taq DNA聚合酶、模板DNA和引物浓度进行了优化,建立了适合鲤的、稳定、可重复的TRAP-PCR反应体系.在15 μl PCR反应体系中,Mg2+浓度为1.5 mmol/L、dNTPs浓度为0.35 mmol/L、两个随机引物浓度均为3 pmol/L、固定引物浓度为10 pmol/L、含DNA模板60 ng、Taq DNA聚合酶1.0 U.鲤的TRAP反应程序为:94℃4 min,1个循环;940C 45 s,35℃ 45 s,72℃ 1 min,5个循环;94℃ 45 s,53℃ 45 s,72℃1 min,35个循环;72℃10 min,1个循环.这一优化体系的建立为今后进行鲤群体遗传多样性、种质鉴定、遗传连锁图谱及亲缘关系分析等方面的研究提供了新的分子标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	袁新华	南京农业大学无锡渔业学院	18	175	6.0	13.0
2	明俊超	南京农业大学无锡渔业学院	11	105	5.0	10.0
3	董在杰	南京农业大学无锡渔业学院	34	412	12.0	20.0
5	苏胜彦	中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室	9	31	3.0	5.0
8	梁政远	南京农业大学无锡渔业学院	7	115	5.0	7.0
9	曲疆奇	南京农业大学无锡渔业学院	2	16	2.0	2.0