基因表达连续分析标签数据库的实时定量多聚酶链反应验证

• 作者: 尹磊淼 张庆华 徐玉东 杨永清 王宇
• 来源期刊: 中国医学科学院学报
• 关键词: 基因表达连续分析 实时定量多聚酶链反应
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 51-54
• 页数: 4页
• 分类号: R34
• 语种: 中文
• DOI: 10.3881/j.issn.1000-503X.2010.01.013

摘要

目的 采用实时定量多聚酶链反应(PCR)技术验证不同丰度和匹配度的基因表达序列标签,尝试用该技术补充和完善高通量基因表达谱的结果.方法 根据各基因序列全长设计引物,选择9个单匹配标签,6个多匹配标签,1个美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库更新后无匹配标签和2个无匹配基因进行实时定量PCR验证.结果 挑选的所有基因均得到特异性扩增.基因表达量分析结果显示,基因表达连续分析(SAGE)文库中9个单匹配标签表达趋势和定量结果一致,且具有显著性差别;6个多匹配标签中有3个标签表达趋势和定量结果一致,且具有显著性差别;1个NCBI数据库更新后无匹配标签表达趋势和定量结果相反;2个无匹配基因表达量数据提示两组间没有显著性差别.结论 实时定量PCR技术是验证SAGE等高通量数据的可靠工具之一.SAGE文库标签匹配度可影响数据的可信度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张庆华		16	148	6.0	12.0
2	尹磊淼	上海中医药大学上海市针灸经络研究所神经生物研究室	26	75	5.0	7.0
3	徐玉东	上海中医药大学上海市针灸经络研究所神经生物研究室	26	76	5.0	7.0
4	王宇	上海中医药大学上海市针灸经络研究所神经生物研究室	47	201	7.0	13.0
5	杨永清	上海中医药大学上海市针灸经络研究所神经生物研究室	40	204	7.0	13.0