CHAP抗生酶数据库的构建及其信息分析

• 作者: 吴宏宇 唐立成 黄青山
• 来源期刊: 中国抗生素杂志
• 关键词: 细菌耐药性 抗生酶 CHAP结构域 数据库
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 微生物药物筛选
• 页码范围: 904-909
• 页数: 6页
• 分类号: R978.1|Q1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-8689.2019.08.003

摘要

目的 建立CHAP抗生酶数据库,对已知的CHAP抗生酶信息进行收集整理,为研究其功能机制,和设计研发新型CHAP抗生酶提供帮助.方法 收集公共数据库和科学文献中的CHAP抗生酶信息,使用UniProtKB,InterPro,PDB,GO和BioPerl进行信息关联和信息注释;使用Apache,MySQL,PHP,Perl和jQuery构建数据库及WEB页面.结果 构建了基于WAMP架构的CHAP抗生酶数据库(http://biotechlab.fudan.edu.cn/database/chap),包含来自于263种来源的1 572种CHAP抗生酶,WEB界面提供浏览、搜索和统计信息等功能,允许用户以自定义的搜索标准快速获取数据,并对CHAP抗生酶的序列、结构、来源、功能、物化性质等信息进行分析.结论 本研究建立的CHAP抗生酶数据库作为抗生酶研究的一个独特工具,具有多种潜在的应用,为进行CHAP抗生酶研究的研究者提供了一个极有用的研究平台.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄青山	复旦大学生命科学院遗传学研究所遗传工程国家重点实验室	22	99	5.0	9.0
2	吴宏宇	复旦大学生命科学院遗传学研究所遗传工程国家重点实验室	10	49	4.0	7.0
6	唐立成	复旦大学生命科学院遗传学研究所遗传工程国家重点实验室	1	0	0.0	0.0