细菌素数据库的构建及信息分析

• 作者: 刘世财 刘潇翔 范琳琳 郑珩 鲍劲霄
• 来源期刊: 中国抗生素杂志
• 关键词: 细菌耐药性 抗菌肽 细菌素 数据库
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 药理与临床
• 页码范围: 418-424
• 页数: 7页
• 分类号: R978.1|Q1
• 语种: 中文

摘要

目的 建立细菌素数据库,并对已知的细菌素信息进行了统计和分析,可为新型细菌素的设计和研发提供帮助.方法 检索大型蛋白质数据库,收集文献中报道的细菌素;使用MySQL、Perl、phpMyAdmin、Apache、FileZilla、HTML和PHP等软件和语言进行数据库网站的建立.结果 收集到了407条细菌素,包括43个PDB结构和2105条活性数据,对细菌素序列信息、结构信息、修饰信息、来源信息、分类信息、活性信息和物化信息进行了详细描述,建立了免费的AMPs from bacterial数据库网站(网址:http://bacteriocins.cpu-bioinfor.org/),提供了搜索(search)、浏览(browse)和相似性比对(blast)等功能.结论 本研究建立的细菌素数据库收集了较全面的信息,对于新型细菌素的研发可起到促进作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑珩	中国药科大学生命科学与技术学院	106	521	13.0	17.0
2	范琳琳	中国药科大学生命科学与技术学院	7	24	3.0	4.0
3	刘世财	中国药科大学生命科学与技术学院	2	16	1.0	2.0
4	鲍劲霄	中国药科大学生命科学与技术学院	1	0	0.0	0.0
5	刘潇翔		1	0	0.0	0.0