鲮Myf5基因克隆及其SNPs分析

• 作者: 史燕 朱新平 潘德博 谢文平 赵建 郑光明 钟茂春 陈昆慈 马丽莎
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鲮鱼 Myf5基因 SSCP 遗传结构
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 681-688
• 分类号: Q959|S96
• 字数: 4414字
• 语种: 中文

摘要

提取新鲜鲮(Cirrhinus molitorella)肌肉总RNA,采用RT-PCR技术分段克隆鲮Myf5基因核心序列,获得1 104bp的目的片段,其中开放阅读框为723 bp,编码240个氨基酸.分析表明,鲮Myf5蛋白具有MRF家族基因的典型性碱性bHLH螺旋-环-螺旋(Basic helix-loop-helix,bHLH)结构.设计特异性引物扩增获得2个内含子,大小分别为1 311 bp和90 bp.用单链构向多态性SSCP的方法分析了Myf5基因在珠江水系3个不同江段鲮中的遗传变异,分布及群体杂合性等群体遗传信息.发现其编码区非常保守,仅在外显子412位点处发生突变C→T.对该位点进行基因型分析,结果表明:珠江北江段鲮中该位点符合Hardy-Weinberg平衡,而东江和西江段种群不符合Hardy-Weinberg平衡,3个江段种群总体上符合Hardy-Weinberg平衡,并存在较大基因流.以Myf5基因该位点的多态性分析表明,3个种群未出现明显分化;通过该位点的遗传结构分析表明:3个江段种群杂合度都较高,中度信息含量(PIC)及多态信息指数,即该位点有较好的变异性及遗传多态性.3个江段种群总体上该位点在不符合Hardy-Weinberg的情况下AA>BB,并由该位点群体杂合性及中性分析表明该位点突变群体具体良好的多态性且不遵循中性选择模式,说明BB型个体受到自然选择.本研究结果表明,鲮Myf5基因的C412T与个体生长有相关性,可作为候选基因标记,用于鲮生长相关分子标记辅助育种研究.