湘西黄牛Myf5和Pax7基因的SNPs检测及其与体尺性状的关联分析

• 作者: 李峰 李德才 王兴平 罗仍卓么 都鑫
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 湘西黄牛 Myf5基因 Pax7基因 单核苷酸多态性 体尺性状
• 年，卷（期）: 2014,（9）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1531-1537
• 页数: 7页
• 分类号: S823.8+1|S813.3
• 字数: 4312字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2014.09.021

摘要

本研究旨在检测湘西黄牛Myf5和Pax7基因的单核苷酸多态性(SNP),探讨湘西黄牛多态性位点的群体遗传特征,寻找与生长发育相关的分子标记.采用PCR和直接测序技术筛查湘西黄牛Myf5基因第2内含子和Pax7基因第3外显子的SNPs;以217头湘西黄牛为研究对象,采用PCR-RFLP方法对群体进行遗传多态性分析,运用最小二乘线性模型进行基因型与体尺性状的关联分析.结果表明,在湘西黄牛Nyf5基因第2内含子中检测到9个SNPs,其中7个是本研究新发现的SNPs;在Pax7基因第3外显子检测到1个SNP.群体遗传多态性分析结果显示,湘西黄牛群体中Myf5基因g.1948A＞G位点的AA、AG和GG基因型频率分别为0.046 1、0.235 0和0.718 9;A和G等位基因频率分别为0.163 6和0.836 4.Pax7基因g.31G＞A位点只检测到AG和GG 2种基因型,基因型频率分别为0.073 7和0.926 3;A和G等位基因频率分别为0.036 9和0.963 1.这2个位点均处于低度多态,且达到了Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05).关联分析结果表明,Myf5基因g.1948A＞G位点的AA和AG型个体的体重显著高于GG型个体的体重(P＜0.05),A等位基因对体重为正效应;而各基因型间的体高、体长和胸围的差异均不显著(P＞0.05).结果提示,湘西黄牛Myf5基因的SNP位点较多,g.1948A＞G位点可能为湘西黄牛体重性状的分子遗传标记位点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王兴平	湖南文理学院生命科学学院湖南省高校动物学重点实验室	25	85	6.0	8.0
2	罗仍卓么	湖南文理学院生命科学学院湖南省高校动物学重点实验室	12	31	3.0	5.0
3	李峰	湖南文理学院生命科学学院湖南省高校动物学重点实验室	22	65	4.0	6.0
4	李德才	湖南文理学院生命科学学院湖南省高校动物学重点实验室	1	8	1.0	1.0
5	都鑫	湖南文理学院生命科学学院湖南省高校动物学重点实验室	1	8	1.0	1.0