豆蔻属药用植物DNA条形码鉴定研究

• 作者: 姚辉 宋经元 石林春 陈士林 韩建萍
• 来源期刊: 世界科学技术-中医药现代化
• 学科: 医学
• 关键词: 豆蔻属 DNA条形码 鉴定
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 页码范围: 473-479
• 分类号: R2
• 字数: 3939字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-3849.2010.03.033

摘要

目的:针对鉴定十分困难的豆蔻属药用植物筛选适合其鉴定的DNA条形码序列,探索豆蔻属药用植物鉴定新方法.方法:对该属植物36个物种,46个样本的8个候选条形码序列(psbAtrnH,matK,rbcL,psbK-psbI,rpoB,atpB-rbcL,ITS,ITS2)进行PCR扩增、测序和序列分析,我们采用了4种方法对于数据进行分析,应用Mega4.1计算不同序列的种间和种内遗传距离(K-2P);用Wilcoxon秩和检验比较不同序列的变异性;用Taxon DNA软件评估"Barcoding Gap";用Blast、Distance方法检验物种鉴定的可靠性.结果:ITS2和ITS序列变异显著,物种水平鉴定成功率达100%,其它6个候选序列(psbA-trnH,matK,rbcL,psbK-psbI,rpoB,atpB-rbcL)不能有效鉴定豆蔻属物种.结论:本文推荐将ITS2和ITS作为豆蔻属药用植物潜在的DNA条形码序列,并依此建立该属药用植物的DNA条形码鉴定方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈士林	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	143	2855	29.0	43.0
2	姚辉	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	42	752	18.0	26.0
3	宋经元	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	65	1414	26.0	34.0
4	石林春	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	19	279	11.0	16.0
5	韩建萍	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	17	321	11.0	17.0